Все меконгские бобтейлы - колор-пойнты, или часто еще этот окрас называют сиамским. У кошек сиамского окраса тело более светлого тона, чем выступающие части тела — пойнты (морда, уши, лапы и хвост), которые окрашены более интенсивно. Поэтому такой окрас называют «пойнтовым», то есть оконечным.

Колор-пойнт относится к группе акромеланических окрасов. Акромеланизм — это явление неполного альбинизма, когда интенсивность окрашивания шерсти зависит от температуры — в теплых частях тела вырабатывается меньше пигмента, чем в холодных, то есть на ушках, мордочке, лапках и хвостике, которые и будут окрашены в более темный цвет.  

Набор генов «Color», который отвечает за синтез пигмента, состоит из нескольких генных форм – из основной формы С и мутантных форм альбинизма. 
Доминантный (главный, подавляющий) ген С дает полное окрашивание шерсти и радужной оболочки глаза в определенный цвет. У однотонных кошек каждый волосок равномерно прокрашен по всей длине.

За сиамский же окрас отвечает ген cs. Под его воздействием пигмент окраски проникает только в те волоски, которые находятся в холодной зоне тела кошки. А там, где температура более высокая, ген cs тормозит проникновение пигмента. Поэтому основной тон корпуса кошки получается не чисто белым, а просто осветленным. Он соответствует окрасу пойнтов. Так, если мордочка, лапы, ушки и хвост кошки ярко-коричневые, то тело будет палевым, если рыжеватые, то цвет тела будет кремовым и т.д.

Меконги рождаются абсолютно белыми, поскольку в чреве матери они развиваются при постоянной высокой температуре. Их мордочка, лапы и хвост начинают темнеть лишь через несколько дней после рождения, когда при понижении температуры тела в этих зонах происходит постепенное проникновение пигмента в волоски. Окончательно окрас устанавливается к 6-10 месяцам.

Особенность сиамского окраса в том, что его тон, оттенок и интенсивность меняются в зависимости от температуры окружающей среды. Чем она ниже, тем кошка темнее. Оптимальная температура для выставочного меконгского бобтейла — 25-28°C.

Ген cs является рецессивным, то есть подавляемым геном сплошного окраса С, поэтому внешне он проявляется только тогда, когда оба родителя передали котенку по гену cs. Таким образом, котенок будет сиамского окраса, если в нем «встретятся» два гена сs. Фокус в том, что и папа-кот, и мама-кошка, являясь просто носителями этого гена, могут быть разных окрасов и даже полностью одноцветными.

Рассмотрим основные окрасы:

Сил-пойнт (n). Окрас шерсти кремовый, темнеющий до светло-коричневого. Маска, уши, ноги, лапы, хвост глубокого черно-коричневого цвета. Полная маска на мордочке соединяется с ушами полосками (этого нет у молодых).

Блю-пойнт (a). Снежно-белый окрас на спине переходит в голубой, того же тона, что и отметины, но светлее. Отметины однотонно голубые. Уши не должны быть темнее, чем другие отметины.

Ред-пойнт (d). Корпус белый: если есть оттенок, то он абрикосовый. Отметины (маска, уши, хвост) яркого золотисто-красного цвета; ноги и лапы золотисто-красные или абрикосовые. Зеркальце носа розовое. Полосы на голове, хвосте, ногах, лапах не считаются недостатком

Табби-пойнт ([a,b,c,d,e,n,o,p...] 21). Кошки табби-пойнт отличаются тем, что отметины у них не однотонные, а с полосками. Корпус бледный, лучше без оттенков, должен соответствовать по цвету стандарту определенного окраса; отметины, как у всех меконгов: "сил", или "блю", или "шоколад", или "лайлак" и т.д. Маска в тон отметин, с полосками. Все отметины - как маска; хвост с четко очерченными кольцами разных размеров, кончик одноцветный. Веки с темным обводом (или в тон отметин).

Торти-пойнт (SIA [f,g,h,j,q,r]). Окрас корпуса, как у отдельных разновидностей меконгов; цвет отметин соответствующий: "сил", или "блю", или "шоколад", или "лила" и т.д. Маска черно-коричневая, голубая, шоколадная или лиловая с пятнами или смешанным красным и кремовым цветами (должно быть отчетливо видно, пятна ли это или смесь цветов). Лапы, хвост окрашены, как маска, распределение пятен на основном тоне отметин и цвет зеркальца носа произвольны.